学会下设8个专业委员会即：
中国超声医学工程学会颅脑超声专业委员会
中国超声医学工程学会眼科超声专业委员会
中国超声医学工程学会超声心动图专业委员会
中国超声医学工程学会腹部超声专业委员会
中国超声医学工程学会超声治疗专业委员会
中国超声医学工程学会仪器工程开发专业委员会
中国超声医学工程学会超声生物效应专业委员会
中国超声医学工程学会计划生育超声专业委员
学会各专业委员会按照学会章程规定的宗旨和业务范围，在总会的授权范围内积极开展各项活动，他们在开展本专业有关课题研究、组织学术交流、推广本专业新技术、新成果、培养专业技术人才、编辑书籍等方面均有突出成绩。就学术交流而言，每个专业委员会，每2~3年举办一次本专业全国性学术交流会，到目前为止大多已举办5~8次，总共已达数十次，其规模函盖全国范围，其交流文章水平，基本上反映了国内最先进水平及最新研究成果。对推动本学科的发展作出重要贡献。
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